Острова Пахтусова мало известны. Контур островов на картах скрадывается берегами Новой Земли. Район расположения островов до последнего времени оставался почти не исследованным. Изучению островов и морской описи их, кроме ледовитости Карского моря, препятствовал сложный рельеф их скалистых берегов, окруженных подводными грядами. Естественно, что мореплаватели избегали приближаться к опасным островам. В то же время с точки зрения как географической, так и экономической район островов Пахтусова представляет одно из самых интересных мест на восточном побережье Новой Земли.

Острова Пахтусова находятся в 100 милях (185 километров) к северу от восточного устья пролива Маточкин Шар, ориентируясь по которому легко найти место-положение островов на карте. Географические координаты островов 74,5° северной широты и 59,5° восточной долготы от Гринича. Острова. расположены при входе в большой залив, далеко вдающийся вглубь Новой Земли, окружая мыс северного берега залива. Остров Пахтусова, протяжением в 6 кило-метров. и остров Южный —9 километров — являются наибольшими из всей группы. Эти острова окружены несколькими маленькими каменистыми островками, представляя таким образом общую группу островов Пахтусова, разделенных между собой каменистыми проливами При наблюдении со стороны моря острова сливаются с берегами Новой Земли, образуя как будто непрерывную береговую линию, закрывая расположенный за ними залив.