В виде понижающихся террас горы крутыми склонами подходят к самому берегу моря. Долины в горах образуют далеко вдающиеся в сушу заливы (фиорды), в которые спускаются ледники.

Местами на побережье располагаются низкие террасы, высотой около 50 метров. Под действием атмосферных явлений (ветер, осадки) и моря (волны, течения, льды) на этих террасах обнажаются твердые породы, образующие изрезанную береговую линию с мысами в виде отвесных скал, состоящих из песчаника, сланцев или известняка. Как продолжение мысов в море выступают подводные и надводные камни. Нередко от мысов отделяются острова. Острова Пахтусова являются остатками нижней террасы, отделяясь от нее узкими проливами, шириной 1—2 километра кроме того образование островов, по-видимому, связано с происхождением залива Циволько, являющегося типичным фиордом. Как известно, происхождение фиордов обязано ледниковым эрозиям. Фиордовые проливы пересекают острова Пахтусова в виде глубоких впадин с крутыми склонами. Поверхность островов неровная, пересеченная долинами с отдельными сглаженными вершинами, высотой 50—70 метров над уровнем моря. Отдельные небольшие острова имеют плоскую поверхность, другие же — в виде курганов. Растительность на островах очень скудная. Обычный тундровый покров лежит на всех местах островов, где не выступают на поверхность твердые породы.

Климат на острове суровый, окружающее их Карское море иногда в течение целого года покрыто льдами. Обычно море освобождается от зимних льдов в августе и в сентябре. Проливы в островах замерзают в ноябре, покрываясь ровным льдом.